Prot
Reveal
Головна
🧭 Хаб
Структури
📖 Інструкція
⚙ Admin
🌗
TWO CRYSTAL STRUCTURES OF THE B1 IMMUNOGLOBULIN-BINDING DOMAIN OF STREPTOCCOCAL PROTEIN G AND COMPARISON WITH NMR
1pgb.pdb · PDB: 1PGB
Інфо
Вигляд
Атом
Зв'язки
⚡
☢️
⚗️
🧬
📊
Загальна інформація
Атомів
460
Залишків
56
Ланцюгів
1
Роздільна зд.
1.92 Å
Організм
STREPTOCOCCUS SP. GX7805
Вторинна структура
α-спіралей
1
β-листків
4
Компоненти
Лігандів
0
Металів/іонів
0
Молекул води
—
Ліганди та іони
Завантаження...
B-фактор
Низький
Середній
Високий
—
Мін
—
Сер.
—
Макс
Ланцюги
🗑 Видалити структуру
Режим відображення
Ланцюг CA
Spacefill
Ball+Stick
Зв'язки
Поверхня
Все разом
Колірна схема
Елемент
Залишок
Струк.
Ланц.
B-фак.
Заряд
Розмір атомів
60
Показувати компоненти
Білок
Ліганди
Метали
Вода
Фільтр ланцюгів
Дії
🎯 Скинути
🔄 Обертання
📋 Легенда
📸 Скрін
Shift+клік = мульти
✕ Очист.
Натисніть на атом
Клацніть будь-який атом для деталей
Вибрані атоми
0
📏 Виміряти
✕ Очистити
🔍 Пошук залишку
📏 Лінійка / Кут
—
Клікніть кнопку і виберіть 2-4 атоми
📏 Увімкнути
φ/ψ Auto
✕ Скинути
📋 Послідовність
↕ Панель
🔬 Завантажити аналіз зв'язків
Водневі зв'язки
Дисульфідні містки
Сольові містки
Типи зв'язків (всього)
⚡ Електростатика
⚡ Розрахувати
+0
Позитивних
0
Заг. заряд
-0
Негативних
Заряджені залишки
🎨 Показати на структурі
☢ Радіаційний аналіз
☢️ Запустити аналіз
—
Індекс стабільності
—
🔬 Радіонуклід
⚡ СИМУЛЯТОР РОЗПАДУ
▶ Симулювати розпад
Авто: всі метали
◎ На структурі
Вразливі залишки (ROS)
⚗️ Важкі метали
⚗️ Аналіз структури
🔁 Metal Replacement / Cementing
Оберіть метал зі структури → замініть на важкий метал → оцініть локальну енергію та згенеруйте constraints.
Метал не вибрано
Pb²⁺ — Свинець
Hg²⁺ — Ртуть
Cd²⁺ — Кадмій
Ni²⁺ — Нікель
Zn²⁺ — Цинк
Cu²⁺ — Мідь
Fe²⁺ — Залізо
Mg²⁺ — Магній
Ca²⁺ — Кальцій
ΔE
PDB
Fix Atoms
📚 База даних
🧬 Мутатор
Клацніть атом → виберіть новий залишок
Поточний:
—
Виберіть новий залишок...
GLY — Гліцин
ALA — Аланін
VAL — Валін
LEU — Лейцин
ILE — Ізолейцин
PRO — Пролін
SER — Серин
THR — Треонін
CYS — Цистеїн
MET — Метіонін
ASN — Аспарагін
GLN — Глутамін
PHE — Фенілаланін
TYR — Тирозин
TRP — Триптофан
HIS — Гістидин
LYS — Лізин
ARG — Аргінін
ASP — Аспартат
GLU — Глутамат
+ Додати мутацію
Список мутацій
0
💾 Зберегти PDB
✕ Очистити
Послідовність після мутацій
📊 Біостатистика
📋 Summary
📈 B-фактор
📐 Геометрія
🧪 Склад
Оберіть аналіз...
Знайти метали в структурі
🔎 Знайти
Завантаження структури...
Ініціалізація
Завантаження...
📏 Лінійка
🖱 Мульти
☢️ ROS
⟳ Скинути
CA
Spacefill
Ball+Stick
Поверхня
Сіквенс ↕
⟳